Ausgedehnte Schilf- und Binsen-Schneideröhrichte bedecken die naturbelassenen Niedermoore am Ostufer der Müritz.
Das Quellgebiet der Havel liegt unmittelbar an der Endmoräne, die die Wasserscheide zwischen Nord- und Ostsee bildet. Die Havel entwässert wie nahezu das gesamte Nationalparkgebiet in Richtung Nordsee.
Der kleinere Serrahn-Teil des Nationalparks östlich von Neustrelitz ist berühmt für seine naturbelassenen Buchenwälder.
Die durch militärische Übungen auf dem Truppenübungsplatz entstandenen Sandwüsten werden spontan wiederbesiedelt.
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