Pero no debemos olvidar las desventajas de esos alimentos. Al momento de alterar su ADN ya sea quitando o incorporando genes, el producto final puede generar agentes nuevos que causen intolerancia o alergias alimentarias. Aunque las desventajas sean pocas, no debemos hacerlas a un lado debido a que las desventajas afectan de manera directa a las personas.