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REVISTA INFÓRMATE - ACTIVIDADES
NF2 y Shwannomatosis
Estado de la técnica
ANTECEDENTES
Desde la identificación del gen NF2 en 1993, más de 4.000 pruebas genéticas se han llevado a cabo en
familias afectadas de NF2 en todo el mundo no relacionadas entre sí (1108 en Manchester). La tasa de
detección de variantes patógenas en el ADN de los leucocitos depende de qué generación se analiza en
una familia.
METODOLOGÍA
Se utilizó el análisis de secuenciación masiva (NGS) y una técnica de amplificación con sonda múltiple
dependiente de ligamento (MLPA) para identificar variantes patógenas en el ADN de los leucocitos y
tumores en individuos que cumplen los criterios de NF2.
RESULTADOS
Al evaluar a miembros de segunda generación de familias con NF2, identificamos una variante patógena
en 143/154 (93%), 31/154 (20%) tenían deleciones o duplicaciones detectables en MLPA. En los 11 sin
una variante en la prueba estándar, se identificaron tres con inversiones que afectaron al extremo 5 (una
familia) y al extremo 3 (dos familias) que requirieron un análisis genómico adicional (ambas faltaron en la
prueba de ARN estándar), otros dos tuvieron traslocaciones de cromosomas identificadas en el análisis
citogenético y en un caso final hubo una variante 5´UTR (c-66-65ins T) que causa un codón de iniciación
temprana.
Por lo tanto, las pruebas adicionales identifican una variante patógena en 149/154 (97%) de las familias
de segunda generación de NF2. En casos simples (es decir, una sola aparición en una familia), la tasa de
detección de mutaciones es de alrededor del 50-60% (516/951). Alrededor del 30% de las mutaciones no
se detectan debido al mosaicismo. Actualmente hemos identificado 217 pacientes en mosaico, 40% por
análisis de tumor. Cuando la mutación no es detectable en la sangre, podemos detectar menos de 1 %
con NGS, particularmente cuando la variante es identificada con análisis de tumor.
Sin embargo, es posible que las variantes aún no se detecten después del análisis dirigido.
La NGS detectó la variante patógena a una frecuencia de alelo del 0,8-9% en 26/54 (48%) de muestras de
ADN de leucocitos en las que Sanger no había podido confirmar esto previamente.
CONCLUSIONES
Un enfoque combinado con secuenciación de NGS y
MLPA junto con pruebas adicionales para evaluar los
extremos 5´ y 3´ del gen NF2 es una técnica altamente
sensible e implica que tres no es otro gen que cause NF2
clásico en múltiples miembros de la familia. NGS es una
ventaja importante en la identificación del mosaico MF2
y proporciona estimaciones para la transmisión de la
descendencia.
Dr. Gareth Evans, Miriam Smith, Andrew Wallace, George Burghel
Medicina Genómica de la Universidad de Manchester, Reino Unido.
Dr. Gareth Evans