Mientras, el presidente Carlos Menem declaraba al edificio Monumento Histórico Nacional, protegiéndolo de potenciales demoliciones. Para fin de dicho mes, las autoridades del San José declaraban a la prensa que el Colegio finalmente seguiría abierto, gracias a un subsidio y a la recolección de fondos realizada.
Desde el 2001, el edificio está siendo alterado irreversiblemente para abrir locales comerciales y cocheras subterráneas en una porción del exterior del colegio. Esta parte fue puesta en alquiler por la congregación para juntar fondos dirigidos al Colegio.
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