El riachuelo se divide en 3 zonas diferenciadas: cuenca baja (altamente urbanizada), cuenca media (semiurbana) y cuenca alta (rural). Los barrios de la Ciudad de Buenos Aires por los que pasa son la Boca y Barracas, y en la provincia atraviesa los municipios de: Almirante Brown, Avellaneda, Cañuelas, Esteban Echeverría, Ezeiza, La Matanza, Lanús, Las Heras, Lobos, Lomas de Zamora, Marcos Paz, Merlo, Morón, Presidente Perón y San Vicente.