El único mamífero cuadrúpedo terrestre autóctono, el guará, mamífero carnívoro de la familia Canidae endémico de las islas Malvinas, de dimensiones intermedias entre las del lobo y las de un zorro grande (era uno de los dos únicos mamíferos terrestres nativos de las Malvinas) pero fue exterminado por los británicos entre 1873 y 1876, también en ese período por ser considerados «plagas» fueron exterminados los chanchos salvajes y las liebres, por otro lado, la fauna de mamíferos terrestre actual es en su totalidad alóctona: animales domésticos y semidomésticos (los caballos y vacunos proceden en gran medida de Argentina), ovinos y recientemente el intento de aclimatación de los renos llevados desde la isla Georgia del Sur.
A mediados de la década de 1990, el biólogo británico Mike Bingham denunció que la sobrepesca y los derrames de petróleo estaban diezmando la población de pingüinos, por este motivo, Bingham fue perseguido pero en 2003 la justicia británica condenó al gobierno de las islas por su accionar. Y en consecuencia, entre 1980 y 1990 la población de pingüinos en las islas Malvinas se redujo en un 84 % pero finalmente desde 1995 la población de pingüino de penacho amarillo y pingüino juanito se estabilizó aunque en un nivel mucho más reducido que el alcanzado antes del establecimiento de las zonas de pesca.