agrophotonique DOSSIER corrélation se révèlent plutôt élevés, notamment pour les acides gras d’ intérêt majeur tels que les oméga 6, l’ EPA et le DHA. Dans une seconde étape, la composition en acides gras de 1382 truites issues d’ une structure génétique familiale contrôlée( 831 familles issues de 84 mères et 99 pères) de l’ entreprise de sélection Aqualande a été prédite par spectrométrie Raman [ 3 ]. Ces valeurs ont permis d’ estimer l’ héritabilité génomique( valeur comprise entre 0 et 1) des concentrations des principaux acides gras( part de la variation due aux parents sélectionnable), en utilisant 29 652 marqueurs génétiques de type SNP, afin d’ évaluer les gains potentiels par sélection [ 4 ]. À la génération suivante, dans le projet Phenomix aussi soutenu par le FEAMPA, l’ héritabilité de la variabilité spectrale elle-même a été étudiée toujours par spectrométrie Raman pour 817 truites issues de 400 familles( croisement de 20 mères et de 20 pères). Si la majorité des bandes spectrales présentent une héritabilité limitée( h ² < 0,05), il s’ avère qu’ à minima trois d’ entre elles présentes des valeurs plus élevées( 0,16 – 0,28), informant sur l’ existence d’ une variabilité génétique portant directement sur certaines signatures vibrationnelles, ouvrant ainsi de nouvelles pistes pour combiner information spectrale et information génomique.
Les travaux initiés montrent la pertinence de la spectrométrie Raman pour prédire la composition en acides gras du gras viscéral chez la truite. Ils révèlent également que certaines bandes spectrales associées à des liaisons biochimiques spécifiques présentent une héritabilité significative. Cette avancée ouvre la voie à l’ investigation d’ outils de spectrométrie Raman, potentiellement portables et à usage industriels en sélection génétique piscicole, pour des mesures non létales des acides gras sur les candidats à la reproduction. L’ application de la spectroscopie Raman sur la chair d’ individus apparentés bien que létale constitue une approche complémentaire permettant, à moindre coût, d’ envisager l’ intégration pérenne de ces caractères dans les schémas de sélection génétique.
LA SPECTROSCOPIE NIR COMME OUTIL DE PHÉNOTYPAGE À HAUT DÉBIT POUR LES ACIDES GRAS DU JAUNE D’ ŒUF: PERFORMANCES PRÉDICTIVES ET IMPLICATIONS GÉNÉTIQUES
Un enjeu majeur pour la filière œuf est l’ allongement de la carrière productive des poules pondeuses, avec des bénéfices économiques, éthiques et environnementaux. Cependant la composition en acides gras du jaune d’ œuf(~ 30 %) n’ a jamais été étudiée et la production, qui dure environ 70 semaines, voit ensuite décliner le taux de ponte ainsi que la solidité de la coquille. Dans ce contexte, l’ un des objectifs du projet européen GERONIMO( Genome and Epigenome eNabled breedIng in MOnogastrics) est d’ étudier la composante génétique des trois principales classes d’ acides gras du jaune d’ œuf, saturés( SFA), mono-insaturés( MUFA) et polyinsaturés( PUFA), dont plusieurs travaux indiquent une évolution au cours de la carrière des pondeuses. L’ estimation des héritabilités( h ²) et des corrélations génétiques permet d’ évaluer quelle mesure la variabilité des caractères entre poules est d’ origine génétique et comment les acides gras du jaune évoluent conjointement avec d’ autres caractères d’ intérêt zootechnique ou fonctionnel. Une telle estimation nécessite toutefois plusieurs centaines d’ animaux, chacun fournissant plusieurs œufs, compte tenu de la variabilité déjà observée entre œufs d’ une même poule. Or, comme chez la truite, l’ analyse des profils lipidiques repose sur une méthode de référence, la chromatographie en phase gazeuse couplée à la détection par ionisation de flamme( GC-FID), précise mais coûteuse et peu adaptée aux études à grande échelle. La spectroscopie proche infrarouge( NIRS) apparaît alors comme une alternative robuste et économique, grâce à une préparation d’ échantillon simplifiée et une acquisition rapide des données spectrales. Dans cette étude, les œufs provenaient de 251 poules issues d’ un schéma de sélection génétique de l’ entreprise Novogen, avec une généalogie connue. Les taux d’ acides gras totaux et des classes SFA, MUFA et PUFA ont été déterminés par GC- FID sur la plateforme Genotoul Metatoul( Toulouse). Les mêmes jaunes
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