Mi primera publicacion GRAM POSITIVOS (Revista Digital 2da Edición 2019) | Page 18

REVISTA GRAM POSITIVOS 2da. Edición.  
INTRODUCCIÓN 
Según   la   Organización   Mundial   de   la   Salud,   en   el   Perú   (2017),   31.079   personas   han   sido  
diagnosticadas   con   tuberculosis   (TB)   y   el   6,3%   de   éstos   casos   corresponde   a   tuberculosis  
multidrogo-resistente   (MDR).   El   primer   estudio   de   la   diversidad   genética   de   MTB   en   el   Perú   de  
aislados   sensibles   y   drogorresistentes,   indica   que   los   genotipos   predominantes   son   Latin  
América-Mediterráneo   (LAM)   y   Haarlem.   Un   segundo   estudio   con   2.139   aislados,   encontró   que  
la   familia   LAM   puede   representar   al   menos   el   50%   de   todos   los   casos   de   resistencia   a  
medicamentos en la región peruana. 
Durante   el   2014,   en   el   Perú   se   realizó   el   secuenciamiento   completo   de   tres   genomas   de   MTB  
(sensible,   MDR   y   XDR)   de   linaje   LAM.   Es   así   que,   el   primer   estudio   se   basó   en   el   análisis  
comparativo   de   tres   secuencias   genómicas   de   MTB:   INS-SEN,   cepa   sensible;   INS-MDR,   cepa  
multidrogorresistente   e   INS-XDR,   cepa   extensamente   resistente,   procedentes   de   la   Ciudad   de  
Lima, Perú [1]. 
Sin   embargo,   la   genotipificación   puede   ser   costosa,   consumir   mucho   tiempo   y,   en   algunos   casos,  
los   resultados   pueden   variar   dependiendo   de   la   metodología   utilizada.   Por   lo   tanto   en   el   segundo  
estudio   se   propuso   un   nuevo   conjunto   de   SNPs   con   base   a   un   total   de   249   genomas   de   MTB   a  
nivel mundial, en el que se incluía las 3 cepas MTB peruanas [2]. 
MATERIALES Y MÉTODOS 
En   el   primer   estudio   se   utilizó   el   criterio   de   inclusión/exclusión   (IE)   usando   spoligotyping   y  
filogenias   para   identificar   los   SNPs   específicos   en   las   cepas   INS-SEN,   INS-MDR   y   INS-XDR.   Se  
compararon   los   tres   genomas   de   MTB   y   se   construyó   una   filogenia   molecular   con   27   cepas   de  
MTB   de   otros   estudios.   Los   SNPs   específicos   en   cada   genoma   fueron   organizados   en   clústers   de  
grupos ortólogos (COGs). 
En   el   segundo   estudio   se   utilizó   el   criterio   de   IE   seguidos   de   la   selección   de   SNPs   no   sinónimos  
presentes   en   los   COGs   más   conservados   de   cada   genotipo   de   MTB.   El   nuevo   conjunto   de   SNPs  
se validó utilizando 34 genomas de MTB con genotipo conocido.  
RESULTADOS Y DISCUSIÓN 
El   análisis   de   genomas   permitió   identificar   un   conjunto   de   SNPs   asociados   a   determinantes   de  
virulencia   (familia   de   proteínas   mce,   policetidos,   phiRv1,   transposasas,   metiltransferasas   y  
relacionados   a   síntesis   de   vitaminas)   principalmente.   Se   observó   una   estrecha   relación   entre   la  
cepa   INS-MDR   y   INS-XDR,   con   solo   un   6,1%   de   SNPs   diferentes,   sin   embargo,   la   cepa   INS-SEN  
presenta   un   50,2   y   50,3%   de   SNPs   diferentes   a   las   cepas   MDR   y   XDR,   respectivamente.   La  

17