El gobierno admite que han existido algunos problemas, pero mantiene que el modelo es único y por lo tanto difícil de implementar. Diversos actores han reconocido algunos importantes logros como el hecho que 4.294 víctimas ya estén a punto de recibir su indemnización correspondiente, los postulados han confesado más de 40.000 crímenes que afectaron a 51.000 personas. Además, con base en información resultante de dichos procesos, las autoridades han entregado 1.318 cuerpos a los familiares.
Un punto que se le ha criticado al gobierno es que entre el 2008 y el 2009 extraditó a 18 paramilitares de alto rango a los Estados Unidos para enfrentar cargos de narcotráfico.
La Ley de Justicia y Paz logra entonces un mejor equilibrio entre los derechos de las víctimas y los beneficios otorgados a los victimarios, pues incentiva una mayor veracidad de las versiones libres, lo cual fortalece la capacidad del Estado de esclarecer la verdad del paramilitarismo.
Desde que se implementó, el gobierno colombiano ha indicado que más de 53,000 paramilitares se han desmovilizado.