TECNOLOGÍAS INTELIGENTES // Software para Empresas
Universidad de Aston desarrolla software en asociación con universidad brasileña
La Universidad de Aston ha trabajado con socios internacionales para desarrollar un paquete de software para ayudar a los científicos a responder preguntas clave sobre factores genéticos asociados con características compartidas entre diferentes especies .
Llamado CALANGO , tiene el potencial de ayudar a los genetistas a investigar temas vitales como la resistencia antibacteriana y la mejora de los cultivos agrícolas .
Este trabajo CALANGO : Una herramienta de genómica comparativa consciente de la filogenia para descubrir asociaciones cuantitativas genotipo-fenotipo entre especies ha sido publicado en la revista Patterns . Es el resultado de una colaboración de cuatro años entre la Universidad de Aston , la Universidad Federal de Minas Gerais en Brasil y otros socios en Brasil , Noruega y los Estados Unidos .
Las similitudes entre especies pueden surgir de ancestros compartidos ( homología ) o de presiones evolutivas compartidas ( evolución convergente ). Por ejemplo , los cuervos , las palomas y los murciélagos pueden volar , pero los dos primeros son aves , mientras que los murciélagos son mamíferos .
Esto significa que es probable que la biología del vuelo en cuervos y palomas comparta aspectos genéticos debido a su ascendencia común . Ambas especies son capaces de volar hoy en día porque su último ancestro común , un ave ancestral , también fue un organismo volador .
En contraste , los murciélagos tienen la capacidad de volar a través de genes potencialmente diferentes a los de las aves , ya que el último ancestro común de aves y mamíferos no fue un animal volador .
Desenredar los componentes genéticos compartidos debido a la ascendencia común de los compartidos debido a las presiones evolutivas comunes requiere modelos estadísticos sofisticados que tengan en cuenta la ascendencia común .
Hasta ahora , esto ha sido un obstáculo para los científicos que desean comprender la aparición de rasgos complejos en diferentes especies , principalmente debido a la falta de marcos adecuados para investigar estas asociaciones .
El nuevo software ha sido diseñado para incorporar efectivamente grandes cantidades de datos de anotación genómica , evolutiva y funcional para explorar los mecanismos genéticos que subyacen a características similares entre diferentes especies que comparten ancestros comunes .
Aunque los modelos estadísticos utilizados en la herramienta no son nuevos , es la primera vez que se combinan para extraer nuevos conocimientos biológicos de los datos genómicos .
La técnica tiene el potencial de aplicarse a muchas áreas diferentes de investigación , lo que permite a los científicos analizar cantidades masivas de datos genéticos de código abierto pertenecientes a miles de organismos con mayor profundidad .
Felipe Campelo , del Departamento de Ciencias de la Computación de la Facultad de Ingeniería y Ciencias Físicas de la Universidad de Aston , dijo : “ Hay muchos ejemplos interesantes de cómo esta herramienta se puede aplicar para resolver los principales problemas que enfrentamos hoy . Estos incluyen explorar la coevolución de bacterias y bacteriófagos y revelar factores asociados con el tamaño de la planta , con implicaciones directas tanto para la agricultura como para la ecología .
“ Otras aplicaciones potenciales incluyen el apoyo a la investigación de la resistencia bacteriana a los antibióticos y del rendimiento de especies vegetales y animales de importancia económica ”.
El autor correspondiente del estudio , Francisco Pereira Lobo , del Departamento de Genética , Ecología y Evolución de la Universidad Federal de Minas Gerais en Brasil , dijo : “ La mayoría de las variaciones genéticas y fenotípicas ocurren entre diferentes especies en lugar de dentro de ellas . Nuestra herramienta recientemente desarrollada permite la generación de hipótesis comprobables sobre las asociaciones genotipofenotipo en múltiples especies que permiten la priorización de objetivos para su posterior caracterización experimental ”. p
www . intelligentcio . com / latam-es INTELLIGENTCIO LATAM 71