Se producen cuándo el fósil se deposita sobre sedimentos blandos, luego queda cubierto por otra capa de sedimentos y se forma una roca. Los fósiles de compresión de vegetales son mucho más comunes que los de animales, generalmente aparecen deformados por la compresión.
Se producen cuándo el organismo se deposita o deja una marca sobre lodo o fango que luego formará una roca.