Redes CYTED tiene la ventaja de apalancar una comunidad científica durante cuatro años, pero en este tiempo la Red conformada debe asegurar los medios para su continuidad a partir de ese punto. Si bien no hay estadísticas oficiales sobre el número de redes que se han mantenido varios años después de terminada la financiación, el tema era un reto a resolver por la coordinación general de IBERMAR y los coordinadores nacionales.
En octubre de 2013 se realizó en Punta del Este( Uruguay) el XV Congreso Latinoamericano de Ciencias del Mar( COLACMAR), el cual convocó más de 1000 científicos de todo el continente, varios de ellos miembros de IBERMAR. Este fue el escenario propicio para celebrar dos reuniones en las cuales participaron la mayoría de coordinadores nacionales y un número importante de investigadores de países miembros, con el objeto de rediseñar la estructura de la Red para su autosostenibilidad financiera y operativa.
El primer cambio fue el traspaso de la Coordinación General de la Universidad de Cádiz a la Universidad Federal de Santa Catarina( Brasil), quienes desde ese momento han llevado el liderazgo de actividades de IBERMAR. Sin embargo la modificación más relevante se dio a la escala
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