Después de todo esto y que Jaime acusó a una brigada del ejército colombiano, también en un importante coctel con muchas personalidades, dijo que un general de dicho ejército lo estaba acusando de ser un colaborador de las FARC. Después de esto se le acuso de otras cosas ilícitas y recibió más amenazas de muchos grupos y personas, pero la más importante fue del jefe paramilitar Carlos Castaño Gil.
El viernes 13 de agosto de 1999 cuando Jaime se dirigía a los estudios Radionet una moto se le emparejó en un semáforo y al decir su nombre le dieron 6 balazos acabando con su vida, cuando sólo tenía 38 años de edad, después de 15 años no hay ningún detenido y el único acusado de esto es el ya fallecido Cataño Gil.
En 2004 se dio a conocer que en el primer tribunal que se llevó a cabo el caso hubo manipulación de muchas cosas, poco a poco se fue dando a la luz información gracias a los líderes de las guerrillas pero ninguna de los dos responsables de tal asesinato, se dio a conocer que el asesinato se mandó a hacer por altos mandos militares de esa apoca y es triste ya que Jaime solo quería lo mejor para su país y a diario quería causar algo en la población con sus personajes para que se dieran cuenta de que el país necesitaba alzar la voz.